2002年，毕军作了人生中的一个重要抉择，决定从美国回国发展。“我喜欢挑战性的工作，希望为自己国家的环保事业做点事情。”就这样，怀揣着心中的“中国梦”，他回到自己的母校南京大学。其时，长三角地区经过县域经济的十年高速发展正成为区域发展的领头羊，与此同时日益严峻的环境资源压力也已成为制约经济高质量持续发展的关键因素。“回到南京大学，我希望自己能成为一名好教授，做好学问，培养好一批又一批的学生”，但同时作为一名环境管理与政策的研究者，“我不能仅仅埋首于象牙塔，应学以致用，以学识参与经济环境协调发展的实践，环境保护与经济发展的良性互动不仅仅是政府的事情，也需要学界的参与”。

     以学术参与现实是毕军的梦想。然而，梦想与现实有多远？课题组的“元老”们回忆起当年刚刚创业的情形。五个成员，挤在南京大学科学楼8楼朝北的一个小小办公室里。冬天天冷，窗户却关不严，没有空调，唯一用作取暖的物品是一个小油町。但回忆起来却非常温暖，因为“大家忘记了外界的纷扰，热火朝天地讨论着项目的每个细节”。每位成员的知识和技能、对实践的认识，都在迅速地积累与提高。

    毕军认为，衡量个人成功的标志并不是能否获得所谓的优越条件，而是在于自己的理念和付出能否得到社会的认可。他回国之初，恰恰是我国循环经济刚刚起步的时候，应用自己在国外掌握的研究动态及经验，回国仅仅2个月，他就和清华大学的教授合作投标获得江苏省循环经济规划项目。以此为起点，毕军迅速成长为我国循环经济和产业生态学领域的主要学者。他领衔编制的苏州工业园循环经济及生态工业园规划得到了包括6位院士组成的专家组的一致好评，苏州工业园也成为我国第一批国家生态工业园区建设示范园区。2008年初，当苏州工业园成为我国首批三家国家级生态工业园称号的时候，那种喜悦对他来说是不言而喻的。从2003年起，他的课题组先后完成了10余个生态工业园、生态市、生态文明、循环经济等规划。2006年作为一名理工科院系的教授，毕军又获得了全国为数不多的、文科最高级别研究课题社科重大招标项目，在这一具有战略性意义的课题中，他和他的同事们不停地探索着我国循环经济发展的创新之路。

    除了循环经济研究，环境风险分析与管理一直是他擅长的领域。他在已故的著名环境学家王华东先生和章申院士的指导下，早在二十年前就开始了环境风险的研究。遗憾的是，该领域的研究在中国长期不被重视处于停滞状态。当2005年11月，松花江污染事件发生而几乎所有的风险预防和应急措施都失败的时候，他感到无比的遗憾和焦虑，因为他10多年前在博士论文里提出的思想如果有三分之一得到应用，整个事件的损失就会减少很多。

    因此，当科技部及时启动863重大项目研发重大环境污染事件应急技术的时候，在曲久辉院士的带领下，他全身心投入到项目设计中，在项目设计最紧张的时候，他平均每个月要在北京和南京之间来回四五趟，最频繁的时候八天来回四次。如今，该重大项目经过5年的实施已圆满验收通过，作为重大项目总体专家组的副组长，他的梦想是，如果再有类似松花江事件的出现，我们的政府和专家不再束手无策。

    在其钟爱的环境管理与政策研究领域，面向国家重大需求，围绕环境管理效率提升和政策优化这一重要命题，和他领导的团队率先设计了基于排污权有偿使用的排污交易制度，丰富和创新了基于信息共享和公开的公众参与制度，主持或主要参与制定了“江苏省太湖流域主要水污染物排放指标有偿使用收费管理办法（试行）”、环境保护部“环境信息公开办法（试行）”等10项环境管理政策并得到政府采纳和应用。

     虽然科研任务繁重，但毕军一直认为积极为政府献计献策，是一件义不容辞的事情，“环境保护是一项重在事前的工作，能够用自己的专业知识为国家的发展尽一份力，这是一个真正的知识分子所应承担的责任”。作为江苏省和南京市两级政府决策咨询“智囊团”的专家、南京市鼓楼区第十、第十一届政协副主席，毕军认为专家建言献策必须经得起实践的检验，“要有好的实践效果，不能当拍脑袋的‘砖家’”。为此，在引进国外先进理念时，他还特别注重基层实践经验的积累。多年来，他深入到苏南等地区进行考察调研，从环境保护最基层的乡镇环保办到县区市环保局，再到各类工业园区、经济开发区及高新区，与第一线环保工作人员、不同类型的污染主体及公众进行广泛的交流，获取第一手的研究素材，这些实实在在的调研为他参与具有操作性的宏观政策设计打下了坚实的基础。“指导实践的理论从实践中来，在实践中检验，这是我以学识参与现实的准则”。回国以来，他先后参与了中共十八大前期关于“生态文明”重要课题的调研并提交报告，参与了致公党中央提交全国政协提案的素材准备工作，参与致公党江苏省委重点课题的调研工作，参与了江苏省全面小康、基本实现现代化的调研和咨询……

    日子忙碌中转瞬划过，时间不够是他最严重的问题，随时随地开始工作，成为他的人生快乐。回国十年来，远在国外的朋友们仍然过得简单而幸福。而选择回国的毕军，则和所有的中国人一起，见证了中国发展的日新月异，见证了中国经济实力再上新台阶。虽然面临着过度繁忙，身体疲惫等诸多困扰，但他从不后悔回到中国。他说，在这样一个转变的大时代，能够倾听中国的脉搏，并参与为他把脉，何其幸也！2008年，他说服了家人放弃美国的工作回国。他说，我的家在中国。话语简单而朴实，其中的真情却千斤重！（晓许）